de la Cruz, Xavier : rechercher sur Z-Library

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Classical molecular interaction potentials: Improved setup procedure in molecular dynamics simulations of proteins

Josep Lluis Gelpí, Susana G. Kalko, Xavier Barril, Jordi Cirera, Xavier de la Cruz, F. Javier Luque, Modesto Orozco

Journal:

Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics

Année:

2001

Langue:

english

Fichier:

PDF, 370 KB

english, 2001

Colecistitis enfisematosa en sospecha de infecciÃ³n por SARS-CoV-2

Bernabeu GarcÃa, Ana, De la Cruz Verdun, Joan, SuÃ±ol Sala, Xavier

Journal:

Cirugía Española

Année:

2020

Fichier:

PDF, 444 KB

2020

Characterization of disease-associated single amino acid polymorphisms in terms of sequence and structure properties

Carles Ferrer-Costa, Modesto Orozco, Xavier de la Cruz

Journal:

Journal of Molecular Biology

Année:

2002

Langue:

english

Fichier:

PDF, 631 KB

english, 2002

Prediction of pathological mutations in proteins: the challenge of integrating sequence conservation and structure stability principles

Riera, Casandra, Lois, Sergio, de la Cruz, Xavier

Journal:

Wiley Interdisciplinary Reviews: Computational Molecular Science

Année:

2014

Langue:

english

Fichier:

PDF, 2.16 MB

english, 2014

Identification and characterization of the novel point mutation m.3634A>G in the mitochondrial MT-ND1 gene associated with LHON syndrome

Carreño-Gago, Lidia, Gamez, Josep, Cámara, Yolanda, Alvarez de la Campa, Elena, Aller-Alvarez, Juan Sebastian, Moncho, Dulce, Salvado, Maria, Galan, Alicia, de la Cruz, Xavier, Pinós, Tomàs, García-Ar

Journal:

Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular Basis of Disease

Année:

2016

Langue:

english

Fichier:

PDF, 818 KB

english, 2016

PMut: a web-based tool for the annotation of pathological variants on proteins, 2017 update

López-Ferrando, Víctor, Gazzo, Andrea, de la Cruz, Xavier, Orozco, Modesto, Gelpí, Josep Ll

Journal:

Nucleic Acids Research

Année:

2017

Langue:

english

Fichier:

PDF, 1.12 MB

english, 2017

Improving the diagnosis of cobalamin and related defects by genomic analysis, plus functional and structural assessment of novel variants

Brasil, Sandra, Leal, Fátima, Vega, Ana, Navarrete, Rosa, Ecay, María Jesús, Desviat, Lourdes R., Riera, Casandra, Padilla, Natàlia, de la Cruz, Xavier, Couce, Mari Luz, Martin-Hernández, Elena, Morai

Journal:

Orphanet Journal of Rare Diseases

Année:

2018

Langue:

english

Fichier:

PDF, 2.01 MB

english, 2018

Suspended Materials in River Waters Differentially Enrich Class 1 Integron- and IncP-1 Plasmid-Carrying Bacteria in Sediments

De la Cruz Barrón, Magali, Merlin, Christophe, Guilloteau, Hélène, Montargès-Pelletier, Emmanuelle, Bellanger, Xavier

Journal:

Frontiers in Microbiology

Année:

2018

Langue:

english

Fichier:

PDF, 544 KB

english, 2018

Consenso 2018 de la Sociedad Española de Anatomía Patológica y la Sociedad Española de Oncología Médica sobre el diagnóstico y tratamiento del cáncer de origen desconocido

Matías-Guiu, Xavier, Fusté, Victòria, Iglesias, Lara, Balañá, Carmen, Concha, Ángel, de la Cruz-Merino, Luis, Nieto, Beatriz, Pané, Maria, Sanz, Julián, Losa, Ferran

Journal:

Revista Española de Patología

Année:

2019

Fichier:

PDF, 1.23 MB

2019

Epigenetic signature for attention-deficit/hyperactivity disorder: identification of miR-26b-5p, miR-185-5p, and miR-191-5p as potential biomarkers in peripheral blood mononuclear cells

Sánchez-Mora, Cristina, Soler Artigas, María, Garcia-Martínez, Iris, Pagerols, Mireia, Rovira, Paula, Richarte, Vanesa, Corrales, Montse, Fadeuilhe, Christian, Padilla, Natàlia, de la Cruz, Xavier, Fr

Journal:

Neuropsychopharmacology

Année:

2018

Langue:

english

Fichier:

PDF, 1.08 MB

english, 2018

Fast synthesis of Na2Ti3O7 system synthesized by microwave-assisted hydrothermal method: Electrical properties

Basilio, L.A.L., Xavier, F., Sales, J.C.C., Andrade, J.C.S., Anglada- Rivera, J., Aguilera, L., Silva, R.S., Rodriguez-Hernandez, J., PÃ©rez de la Cruz, J., Leyet, Y.

Journal:

Ceramics International

Année:

2020

Fichier:

PDF, 1.63 MB

2020

Updating the Mediterranean Diet Pyramid towards Sustainability: Focus on Environmental Concerns

Serra-Majem, LluÃs, Tomaino, Laura, Dernini, Sandro, Berry, Elliot M., Lairon, Denis, Ngo de la Cruz, Joy, Bach-Faig, Anna, Donini, Lorenzo M., Medina, Francesc-Xavier, Belahsen, Rekia, Piscopo, Suza

Journal:

International Journal of Environmental Research and Public Health

Année:

2020

Fichier:

PDF, 1.05 MB

2020

Do protein motifs read the histone code?

Xavier de la Cruz, Sergio Lois, Sara Sánchez-Molina, Marian A. Martínez-Balbás

Journal:

BioEssays

Année:

2005

Langue:

english

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PDF, 263 KB

english, 2005

Representation of noncovalent interactions in protein structures

Xavier de la Cruz, Jesús Reverter, Ignacio Fita

Journal:

Journal of Molecular Graphics

Année:

1992

Langue:

english

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PDF, 524 KB

english, 1992

Bacterial conjugation: a two-step mechanism for DNA transport

Matxalen Llosa, F. Xavier Gomis-Rüth, Miquel Coll, Fernando de la Cruz

Journal:

Molecular Microbiology

Année:

2002

Langue:

english

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PDF, 81 KB

english, 2002

Preservation of protein clefts in comparative models

David Piedra, Sergi Lois, Xavier de la Cruz

Journal:

BMC Structural Biology

Année:

2008

Langue:

english

Fichier:

PDF, 1.12 MB

english, 2008

The structural homology between uteroglobin and the pore-forming domain of colicin A suggests a possible mechanism of action for uteroglobin

Xavier De La Cruz, B. Lee

Journal:

Protein Science

Année:

1996

Langue:

english

Fichier:

PDF, 2.06 MB

english, 1996

Use of structure comparison methods for the refinement of protein structure predictions. I. Identifying the structural family of a protein from low-resolution models

Xavier de la Cruz, Ian Sillitoe, Christine Orengo

Journal:

Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics

Année:

2002

Langue:

english

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PDF, 417 KB

english, 2002

Linear response theory: An alternative to PB and GB methods for the analysis of molecular dynamics trajectories?

Antonio Morreale, Xavier de la Cruz, Tim Meyer, Josep Lluís Gelpí, F. Javier Luque, Modesto Orozco

Journal:

Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics

Année:

2004

Langue:

english

Fichier:

PDF, 598 KB

english, 2004

Partition of protein solvation into group contributions from molecular dynamics simulations

Antonio Morreale, Xavier de la Cruz, Tim Meyer, Josep Lluís Gelpí, F. Javier Luque, Modesto Orozco

Journal:

Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics

Année:

2005

Langue:

english

Fichier:

PDF, 774 KB

english, 2005

Use of bioinformatics tools for the annotation of disease-associated mutations in animal models

Carles Ferrer-Costa, Modesto Orozco, Xavier de la Cruz

Journal:

Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics

Année:

2005

Langue:

english

Fichier:

PDF, 311 KB

english, 2005

10.1038/35054586

Gomis-Rüth, F. Xavier, Moncalián, Gabriel, Pérez-Luque, Rosa, González, Ana, Cabezón, Elena, de la Cruz, Fernando, Coll, Miquel

Journal:

Nature

Année:

2001

Langue:

english

Fichier:

PDF, 567 KB

english, 2001

Recognition and processing of the origin of transfer DNA by conjugative relaxase TrwC

Guasch, Alicia, Lucas, María, Moncalián, Gabriel, Cabezas, Matilde, Pérez-Luque, Rosa, Gomis-Rüth, F Xavier, de la Cruz, Fernando, Coll, Miquel

Journal:

Natural Structural Biology

Année:

2003

Langue:

english

Fichier:

PDF, 850 KB

english, 2003

Corrigendum: Recognition and processing of the origin of transfer DNA by conjugative relaxase TrwC

Guasch, Alicia, Lucas, María, Moncalián, Gabriel, Cabezas, Matilde, Pérez-Luque, Rosa, Gomis-Rüth, F Xavier, de la Cruz, Fernando, Coll, Miquel

Journal:

Nature Structural and Molecular Biology

Année:

2004

Langue:

english

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PDF, 49 KB

english, 2004

Use of surface area computations to describe atom–atom interactions

Xavier de la Cruz, Miquel Calvo

Journal:

Journal of Computer-Aided Molecular Design

Année:

2001

Langue:

english

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PDF, 160 KB

english, 2001

Total rupture of the gastro-oesophageal junction after blunt trauma

Jaume Fernández-Llamazares, Pau Moreno, Francesc García, Xavier Mira, Rosa Catalán, Joan De la Cruz

Journal:

European Journal of Surgery

Année:

1999

Langue:

english

Fichier:

PDF, 31 KB

english, 1999

A fast method for the determination of fractional contributions to solvation in proteins

David Talavera, Antonio Morreale, Tim Meyer, Adam Hospital, Carles Ferrer-Costa, Josep Lluis Gelpi, Xavier de la Cruz, Robert Soliva, F. Javier Luque, Modesto Orozco

Journal:

Protein Science

Année:

2006

Langue:

english

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PDF, 615 KB

english, 2006

Factors limiting the performance of prediction-based fold recognition methods

Xavier De La Cruz, Janet M. Thornton

Journal:

Protein Science

Année:

1999

Langue:

english

Fichier:

PDF, 732 KB

english, 1999

Characterization of the impact of alternative splicing on protein dynamics: The cases of glutathione S-transferase and ectodysplasin-A isoforms

Montserrat Barbany, Jordi Morata, Tim Meyer, Sergi Lois, Modesto Orozco, Xavier de la Cruz

Journal:

Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics

Année:

2012

Langue:

english

Fichier:

PDF, 1.25 MB

english, 2012

An Atomistic View to the Gas Phase Proteome

Tim Meyer, Xavier de la Cruz, Modesto Orozco

Journal:

Structure

Année:

2009

Langue:

english

Fichier:

PDF, 660 KB

english, 2009

Adenocarcinoma de vesícula biliar: estadio tumoral, factores pronósticos histológicos y supervivencia

Joan de la Cruz, L.A. Hidalgo, J. Feliu, Carme Admella, R. Muns, M. del Bas, Xavier Suñol

Journal:

Cirugía Española

Année:

2005

Fichier:

PDF, 72 KB

2005

Discrete representations of the protein Cα chain

Xavier F de la Cruz, Michael W Mahoney, Byungkook Lee

Journal:

Folding and Design

Année:

1997

Langue:

english

Fichier:

PDF, 196 KB

english, 1997

A new procedure for constructing peptides into a given C

Yanli Wang, Hassan I Huq, Xavier F de la Cruz, Byungkook Lee

Journal:

Folding and Design

Année:

1998

Langue:

english

Fichier:

PDF, 184 KB

english, 1998

A procedure for identifying homologous alternative splicing events

David Talavera, Adam Hospital, Modesto Orozco, Xavier de la Cruz

Journal:

BMC Bioinformatics

Année:

2007

Langue:

english

Fichier:

PDF, 425 KB

english, 2007

The functional modulation of epigenetic regulators by alternative splicing

Sergio Lois, Noemí Blanco, Marian Martínez-Balbás, Xavier de la Cruz

Journal:

BMC Genomics

Année:

2007

Langue:

english

Fichier:

PDF, 714 KB

english, 2007

Investigation of shape variations in the antibody binding site by molecular dynamics computer simulation

Xavier de la Cruz, Alan E. Mark, José Tormo, Ignacio Fita, Wilfred F. van Gunsteren

Journal:

Journal of Molecular Biology

Année:

1994

Langue:

english

Fichier:

PDF, 1.05 MB

english, 1994

Alternative Splicing Mechanisms for the Modulation of Protein Function: Conservation Between Human and Other Species

Abel Valenzuela, David Talavera, Modesto Orozco, Xavier de la Cruz

Journal:

Journal of Molecular Biology

Année:

2004

Langue:

english

Fichier:

PDF, 346 KB

english, 2004

Characterization of Compensated Mutations in Terms of Structural and Physico-Chemical Properties

Carles Ferrer-Costa, Modesto Orozco, Xavier de la Cruz

Journal:

Journal of Molecular Biology

Année:

2007

Langue:

english

Fichier:

PDF, 517 KB

english, 2007

Structure and role of coupling proteins in conjugal DNA transfer

F.Xavier Gomis-Rüth, Fernando de la Cruz, Miquel Coll

Journal:

Research in Microbiology

Année:

2002

Langue:

english

Fichier:

PDF, 254 KB

english, 2002

Red de investigación clínica y básica en insuficiencia cardiaca (REDINSCOR). Redes temáticas de investigación cooperativa del Instituto de Salud Carlos III

Luis Alonso-Pulpón, Xavier Borrás, Josep Brugada, Juan Cinca, Arturo Fernández Cruz, José R. González Juanatey, Carlos Sáenz de la Calzada, Mariano Valdés, Rafael Vázquez, Julián Pérez Villacastín

Journal:

Revista Española de Cardiología

Année:

2008

Fichier:

PDF, 100 KB

2008

Data Mining of Molecular Dynamics Trajectories of Nucleic Acids

Noy, Agnes, Meyer, Tim, Rueda, Manuel, Ferrer, Carles, Valencia, Antonio, Pérez, Alberto, de la Cruz, Xavier, López-Bes, J. M., Pouplana, R., Fernandez-Recio, J., Luque, F. Javier, Orozco, Modesto

Journal:

Journal of Biomolecular Structure and Dynamics

Année:

2006

Langue:

english

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PDF, 1.50 MB

english, 2006

Identification and characterization of a novel splice site mutation in the SERPING1 gene in a family with hereditary angioedema

Colobran, Roger, Lois, Sergio, de la Cruz, Xavier, Pujol-Borrell, Ricardo, Hernández-González, Manuel, Guilarte, Mar

Journal:

Clinical Immunology

Année:

2014

Langue:

english

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PDF, 483 KB

english, 2014

Exploring the Essential Dynamics of B-DNA

Pérez, Alberto, Blas, José Ramón, Rueda, Manuel, López-Bes, Jose María, de la Cruz, Xavier, Orozco, Modesto

Journal:

Journal of Chemical Theory and Computation

Année:

2005

Langue:

english

Fichier:

PDF, 168 KB

english, 2005

Scoring by Intermolecular Pairwise Propensities of Exposed Residues (SIPPER): A New Efficient Potential for Protein−Protein Docking

Pons, Carles, Talavera, David, de la Cruz, Xavier, Orozco, Modesto, Fernandez-Recio, Juan

Journal:

Journal of Chemical Information and Modeling

Année:

2011

Langue:

english

Fichier:

PDF, 3.62 MB

english, 2011

Exploring the Binding Mode of Semicarbazide-Sensitive Amine Oxidase/VAP-1: Identification of Novel Substrates with Insulin-like Activity

Marti, Luc, Abella, Anna, de la Cruz, Xavier, García-Vicente, Silvia, Unzeta, Mercedes, Carpéné, Christian, Palacín, Manuel, Testar, Xavier, Orozco, Modesto, Zorzano, Antonio

Journal:

Journal of Medicinal Chemistry

Année:

2004

Langue:

english

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PDF, 549 KB

english, 2004

Quality of life in patients with non–muscle-invasive bladder cancer: One-year results of a multicentre prospective cohort study

Schmidt, Stefanie, Francés, Albert, Lorente Garin, José Antonio, Juanpere, Nuria, Lloreta Trull, José, Bonfill, Xavier, Martinez-Zapata, María José, Morales Suarez-Varela, Maria, de la Cruz, Javier, E

Journal:

Urologic Oncology: Seminars and Original Investigations

Année:

2015

Langue:

english

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english, 2015

Molecular damage in Fabry disease: Characterization and prediction of alpha-galactosidase A pathological mutations

Riera, Casandra, Lois, Sergio, Domínguez, Carmen, Fernandez-Cadenas, Israel, Montaner, Joan, Rodríguez-Sureda, Victor, de la Cruz, Xavier

Journal:

Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics

Année:

2015

Langue:

english

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PDF, 834 KB

english, 2015

Alternative Splicing of Transcription Factors' Genes: Beyond the Increase of Proteome Diversity

Talavera, David, Orozco, Modesto, de la Cruz, Xavier

Journal:

Comparative and Functional Genomics

Année:

2009

Langue:

english

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PDF, 232 KB

english, 2009

The (In)dependence of Alternative Splicing and Gene Duplication

Talavera, David, Vogel, Christine, Orozco, Modesto, Teichmann, Sarah A., de la Cruz, Xavier

Journal:

PLoS Computational Biology

Année:

2007

Langue:

english

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PDF, 787 KB

english, 2007

Capacity of dental equipment to interfere with cardiac implantable electrical devices

Lahor-Soler, Eduard, Miranda-Rius, Jaume, Brunet-Llobet, Lluís, Sabaté de la Cruz, Xavier

Journal:

European Journal of Oral Sciences

Année:

2015

Langue:

english

Fichier:

PDF, 278 KB

english, 2015